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“微生物組大數據搜索引擎”入選“2016年中國醫藥生物技術十大進展”


錄入時間:2017-10-20 10:25:17
    目前,中科院青島生物能源與過程研究所研發的“微生物組大數據搜索引擎”(Microbiome Search Engine; MSE)入選“2016年中國醫藥生物技術十大進展”。
    微生物組(又稱“菌群”)在人體中與生俱來,與人體健康息息相關。因此,對海量微生物組“大數據”的搜索與挖掘,有助于認識微生物組與疾病或生態災害的關系,從而服務于生態系統的精準健康、精準護理與精準營養。
    MSE首先建立了針對元基因組數據的超高速比對算法和數字索引機制,通過機器學習等手段,自動建立基于菌群的疾病與生態災害的診斷與預測模型,從而計算“微生物組診斷與預警指數”,以判別菌群針對特定疾病的狀態和風險。青島生物能源所通過國際科技合作,借助MSE在世界上率先建立了基于人體共生菌群的口腔健康風險評估體系。目前正通過全國和國際范圍內的口腔菌群大數據分析,系統考察人種、年齡、地域、生活習慣等因素對于這一健康風險評估體系的影響。MSE正通過“生物高通量檢測分析”項目,支撐著寶潔公司等近十個世界五百強企業和國家重點實驗室針對腸道、口腔、皮膚、海洋、土壤等生態系統的精準診斷、個體化護理與生態修復。MSE正成為“微生物組數據科學”的一個使能工具,服務于國內外同行針對已知微生物組數據空間的全局性思考與系統性挖掘。

 

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